工藤新一是全國著名的高中（zhōng）生（shēng）偵探，在一次追查黑衣人犯罪團夥（huǒ）時不幸被團夥成員發現，擊暈後喂了神奇的藥（yào）水，工藤新一變回了小孩！新一找到了經常幫助他的阿笠博士，博士為他度（dù）身（shēn）打造不少間諜武器。為了（le）防止犯罪團夥（huǒ）對他進行（háng）報複，新一決定隱（yǐn）姓埋（mái）名，暗中追查他們，希望能得到解藥。一日，新一的女友毛利蘭來到了阿笠博士的家（jiā）尋找男友的（de）下（xià）落，被小蘭撞見的新（xīn）一情急之（zhī）下編造（zào）了自己名叫江戶川柯（kē）南，隨後柯南寄居在了小蘭家（jiā）。小蘭的父親毛利小五郎是一名私家偵探，新一可（kě）以籍著和他一起四出辦案（àn）一（yī）起追查黑（hēi）夜人的下落。柯南（nán）在小（xiǎo）學認識步美（měi）等小學（xué）生，他們一（yī）