工藤新一是（shì）全國著名的高中生偵（zhēn）探，在一次追查黑衣人犯罪（zuì）團夥時不幸被（bèi）團夥成員發現，擊暈後喂了神奇的藥水，工藤新一變回了小孩！新一找到了經常幫助他的阿笠博士，博士為他度身打造不少間（jiān）諜武器。為了防止犯罪團夥對他進行報複，新一決定隱姓（xìng）埋名，暗中追查他們，希望能得到（dào）解藥。一日，新一（yī）的女友毛利蘭來到了阿笠博士的家尋（xún）找男友的下落，被小蘭撞見的新一情急之下編造（zào）了自己名（míng）叫江戶川柯南（nán），隨後柯南寄居在（zài）了小蘭家。小蘭的父親毛利小五郎（láng）是一名私家偵（zhēn）探，新一（yī）可以籍著和他一起四出辦案一起追查黑夜（yè）人的下落。柯南在小學認識步美等小學生，他們一